Produkty

Niealkoholowa stłuszczeniowa choroba wątroby (NAFLD) charakteryzuje się szerokim spektrum stanów chorobowych, od łagodnego stłuszczenia charakteryzującego się nieprawidłowym zatrzymywaniem lipidów w komórkach wątroby do stłuszczeniowego zapalenia wątroby (NASH) objawiającego się nagromadzeniem tłuszczu, stanem zapalnym, balonowaniem i degradacją hepatocytów oraz zwłóknieniem.Ostatecznie stłuszczeniowe zapalenie wątroby może prowadzić do marskości wątroby i raka wątrobowokomórkowego. W tym badaniu przeanalizowaliśmy trzy różne szczepy myszy, A/J, C57BL/6J i PWD/PhJ, które wykazują różne stopnie stłuszczeniowego zapalenia wątroby po podaniu 3,5-dietoksykarbonylu Dieta zawierająca -1,4-dihydrokolidynę (DDC).Zastosowano analizę ekspresji genów RNA-Seq, analizę białek i profilowanie metaboliczne w celu zidentyfikowania różnicowo eksprymowanych genów/białek i zaburzonych poziomów metabolitów próbek wątroby myszy po traktowaniu DDC.Analiza szlaków ujawniła zmianę metabolizmu kwasu arachidonowego (AA) i S-adenozylometioniny (SAMe) na innych szlakach.Aby zrozumieć zmiany metaboliczne metabolizmu kwasu arachidonowego w świetle profili ekspresji choroby, opracowano i zoptymalizowano kinetyczny model tego szlaku zgodnie z poziomami metabolitów.Następnie model wykorzystano do badania in silico wpływu potencjalnych celów leków na stłuszczeniowe zapalenie wątroby. Stwierdziliśmy, że metabolizm AA/eikozanoidów jest silnie zaburzony u myszy indukowanych DDC, stosując połączenie podejścia eksperymentalnego i in silico.Nasza analiza szlaku metabolicznego AA / eikozanoidów sugeruje, że kwas 5-hydroksyeikozatetraenowy (5-HETE), kwas 15-hydroksyeikozatetraenowy (15-HETE) i prostaglandyna D2 (PGD2) są zaburzone u myszy DDC.Ponadto pokazujemy, że model dynamiczny może być wykorzystany do jakościowego przewidywania zmian metabolicznych na podstawie danych transkryptomicznych w kontekście związanym z chorobą.Ponadto stwierdzono, że metabolizm SAMe jest zaburzony z powodu leczenia DDC.Kilka genów, a także niektóre metabolity tego modułu wykazują różnice między A/J i C57BL/6J z jednej strony a PWD/PhJ z drugiej.