Produkty

Spektroskopię w podczerwieni zastosowano do mapowania interakcji substrat-białko: zmiany konformacyjne retikulum sarkoplazmatycznego Ca (2+) -ATPazy po wiązaniu nukleotydów i fosforylacji ATPazy monitorowano za pomocą substratu ATP i analogów ATP (2'-deoksy-ATP, 3 '-deoksy-ATP i 5'-trifosforan inozyny), które zostały zmodyfikowane w określonych grupach funkcyjnych substratu.Modyfikacje 2'-OH, 3'-OH i grupy aminowej adeniny zmniejszają zakres zmian konformacyjnych ATPazy wywołanych przez wiązanie, ze szczególnie silnymi efektami obserwowanymi w przypadku dwóch ostatnich.Pokazuje to strukturalną wrażliwość kompleksu nukleotyd-ATPaza na indywidualne interakcje między nukleotydem a ATPazą.Wszystkie badane grupy są ważne dla wiązania, a interakcje danej grupy ligandów z ATPazą zależą od interakcji innych grup ligandów.Fosforylację ATPazy zaobserwowano dla ITP i 2'-deoksy-ATP, ale nie dla 3'-deoksy-ATP.Nie ma bezpośredniego związku między zakresem zmiany konformacyjnej po związaniu nukleotydu a szybkością fosforylacji, co pokazuje, że pełny zakres zmiany konformacyjnej indukowanej przez ATP nie jest obowiązkowy dla fosforylacji.Jak zaobserwowano dla kompleksu nukleotyd-ATPaza, konformacja pierwszego pośredniego fosforylowanego ATPazy E1PCa (2) zależy również od nukleotydu, co wskazuje, że stany ATPazy mają mniej jednolitą konformację niż wcześniej przewidywano.