Produkty

Referencyjna sekwencja ludzkiego genomu przygotowała grunt pod badania zmienności genetycznej i jej związku z chorobami człowieka, ale badania epigenomiczne nie mają podobnego odniesienia.Aby zaspokoić tę potrzebę, konsorcjum NIH Roadmap Epigenomics Consortium wygenerowało największy jak dotąd zbiór ludzkich epigenomów dla pierwotnych komórek i tkanek.Tutaj opisujemy analizę integracyjną 111 referencyjnych ludzkich epigenomów wygenerowanych w ramach programu, profilowanych pod kątem wzorców modyfikacji histonów, dostępności DNA, metylacji DNA i ekspresji RNA.Tworzymy globalne mapy elementów regulacyjnych, definiujemy moduły regulacyjne skoordynowanych działań oraz ich prawdopodobne aktywatory i represory.Pokazujemy, że warianty genetyczne związane z chorobą i cechami są wzbogacone w specyficzne tkankowo znaczniki epigenomiczne, ujawniając biologicznie istotne typy komórek dla różnych cech ludzkich i dostarczając zasobów do interpretacji molekularnych podstaw chorób ludzkich.Nasze wyniki pokazują centralną rolę informacji epigenomicznych w zrozumieniu regulacji genów, różnicowania komórkowego i chorób człowieka.