Produkty

Dioksygenazy Tet 5-metylocytozyny katalizują demetylację DNA poprzez wytwarzanie 5-hydroksymetylocytozyny i dalszych produktów utleniania.Tet1 i Tet2 ulegają silnej ekspresji w mysich komórkach pluripotencjalnych i obniżeniu w różnym stopniu w komórkach somatycznych, ale mechanizmy transkrypcji są niejasne.Tutaj zdefiniowaliśmy domeny promotora i wzmacniacza w Tet1 i Tet2.W obrębie 15-kb „superwzmacniacza” Tet1 znajdują się dwa miejsca startu transkrypcji (TSS) z różnymi wzorami aktywacji podczas rozwoju.Region promotora 6 kb powyżej dystalnego TSS jest wysoce aktywny w naiwnych komórkach pluripotencjalnych, autonomicznie zgłasza ekspresję Tet1 w systemie transgenicznym i szybko ulega metylacji DNA i wyciszeniu po różnicowaniu w hodowanych komórkach i natywnym epiblastu.Drugi TSS w dół, związany z konstytutywnie słabym promotorem bogatym w CpG, jest aktywowany przez sąsiedni wzmacniacz w naiwnych zarodkowych komórkach macierzystych (ESC) i pobudzonych komórkach epiblastopodobnych (EpiLC).Tet2 ma promotor wyspy CpG o aktywności niezależnej od pluripotencji i dystalny wewnątrzgenowy wzmacniacz specyficzny dla ESC;ten ostatni jest szybko regulowany w dół w EpiLC.Nasze badanie ujawnia różne tryby regulacji transkrypcji w Tet1 i Tet2 podczas przejść stanu komórki we wczesnym rozwoju.Nowi reporterzy transgeniczni wykorzystujący domeny cis-regulatorowe Tet1 i Tet2 mogą służyć do rozróżnienia zniuansowanych zmian w stanach pluripotentnych i leżących u ich podstaw zmian epigenetycznych.